Игра является третьей частью серии игр Red Faction и повествует о событиях, которые происходят через 50 лет после окончания первой части. Действие всей игры проходит на Марсе в 2125 году. Протагонистом в игре выступает Алек Мейсон (англ. Alec Mason), горный инженер[3], который присоединился к партизанам и ведёт борьбу против оккупантов из Earth Defense Force (русск. Силы обороны Земли(СОЗ)).
«Red Faction: Guerrilla» использует игровой движок Geo-Mod второй версии. В качестве физического движка используется Havok. Основной особенностью «Geo-Mod 2» является возможность полной разрушаемости любых искусственных построек на игровом уровне.